Trong những ngày cuối cùng của Cộng hòa, Chiến tranh giữa các vì sao vũ trụ đã giáng một đòn mạnh vào phe ánh sáng của Thần lực. Trong một lệnh nhanh chóng, Hoàng đế Palpatine đã kích hoạt Mệnh lệnh 66. Giao thức được cấy qua chip vào mỗi binh sĩ trong đội quân nhân bản và sau khi được kích hoạt, buộc những người lính phải hành quyết tất cả Jedi trong vùng lân cận của họ. Cuộc thanh trừng Jedi vĩ đại đã đưa một số lượng lớn Jedi yên nghỉ và cùng với cái chết của họ, kết thúc bất kỳ nhiệm vụ và bí ẩn nào vẫn còn chưa hoàn thành.
Trong số tất cả các Jedi ngã xuống vào ngày định mệnh đó, không ai có vẻ tàn bạo bằng cái chết của Aayla Secura trên hành tinh Felucia sôi động. Star Wars Episode III: Revenge of the Sith cho thấy Twi'lek trẻ tuổi bị bắn hạ bởi tiểu đoàn nhân bản của cô ấy. Đáng buồn thay, khi cô ấy bị ngã, cô ấy đã bị phân tâm bởi một con chim và không thể phản ứng. Tuy nhiên, cảnh quay kéo dài thêm vài giây và cho thấy người nhái tiếp tục bắn vào cơ thể trơ xương của cô. Nhiều câu hỏi đã đặt ra từ sự sụp đổ khủng khiếp của cô khi người hâm mộ cố gắng tìm ra lý do tại sao các bản sao lại có vẻ máu lạnh đối với cô như vậy.
Giống như chủ nhân của mình, Quinlan Vos, Secura đã chọn con đường của riêng mình trong khi chú ý đến Lệnh Jedi. Điều này được thể hiện trong cách cô ấy lựa chọn trang phục và cách cô ấy sử dụng thanh kiếm đèn bằng tay cầm ngược. Secura quan tâm sâu sắc đến chủ nhân của cô, người có sức mạnh duy nhất trong Thần lực. Nhiều nhà lý thuyết tin rằng cô ấy cũng có sức mạnh to lớn trong Thần lực. Nếu trường hợp này xảy ra, lý do khiến các phân thân bắn hạ cô ấy có thể là để đảm bảo rằng cô ấy sẽ không đứng dậy để gây sát thương lớn với khả năng của mình.
Hầu hết các cuộc phiêu lưu của Secura không cho thấy cô ấy sử dụng bất kỳ sức mạnh to lớn nào của Thần lực trong Chiến tranh Nhân bản. Mặc dù vậy, hoàn toàn có thể là khả năng của cô ấy vẫn chưa thể hiện hết. Ngoài ra, sức mạnh của cô ấy có thể được chuyển hóa thông qua khả năng chiến đấu của cô ấy, sử dụng kiếm ánh sáng chiến đấu Dạng IV và Dạng V, và bao gồm vô số các động tác nhào lộn và tấn công với tốc độ nhanh.
Một giả thuyết khác được đưa ra gắn chặt vào mối quan hệ của Secura với tiểu đoàn nhân bản của cô ấy. Do Jedi đã trải qua nhiều năm cùng với đội quân nhân bản của họ, nhiều mối quan hệ đã được hình thành giữa hai nhóm. Một số ví dụ điển hình bao gồm Captain Rex và Ahsoka Tano hoặc Commander Cody và Obi-Wan Kenobi. Với logic đó, những người nhân bản có thể đã liên tục tấn công Secura vì họ nhớ lại lịch sử mà họ đã chia sẻ với cô ấy và muốn đảm bảo rằng cái chết của cô ấy sẽ nhanh chóng và không đau đớn. Nếu đúng, điều đó sẽ khiến hành động cuối cùng của họ với tư cách là những người lính nhân bản trở thành một trong những người nhân từ nhất trong Cuộc thanh trừng.
Aayla Secura là một trong những Jedi nhân hậu nhất trong trật tự. Do đó, kết thúc bạo lực của cô đã được coi là một trong những kết thúc tàn bạo nhất của Cuộc thanh trừng Jedi vĩ đại. Cái chết của Secura cũng đại diện cho sự tàn phá nhanh chóng và phẫu thuật mà Hoàng đế đã đặt ra để đạt được. Cần rất nhiều để giết một Jedi, và thậm chí cả Anakin Skywalker trong The Phantom Menace không tin có thể đánh bại tất cả. Tuy nhiên, Hoàng đế đã chứng minh anh ta sai bằng cách xóa sổ gần như tất cả mọi người trong số họ trong một cú ngã sà xuống.
Cái chết của hầu hết mọi Jedi đến nhanh chóng và dữ dội. Trong sự kiện này, một số cảm giác cuối cùng mà những người sử dụng Force còn sống sót cảm thấy là sự phản bội và đau đớn. Ngay cả cái chết của Secura cũng liên quan đến Yoda, người đang ở trên một hành tinh hoàn toàn khác vào thời điểm đó. Lý do chính xác tại sao người nhái lại bắn nhiều lần vào Secura vẫn còn là một bí ẩn. Tuy nhiên, bí ẩn đó đã cho phép người hâm mộ đến với nhau, một lần nữa, để suy đoán về nhiều bí ẩn khác trong vũ trụ Chiến tranh giữa các vì sao.
